藥物流產吃米非司酮時，基本上不疼，吃米索前列醇會疼。米索前列醇促進子宮收縮，使胎囊排下來。一般藥物有3個小時的作用，如果3個小時排出來了，就不疼了。如果沒有排下來，可能還要再吃一次，可能又有3個小時刺激子宮收縮，所以疼一般就是這幾個小時。如果疼了6個小時還沒下來，可能就需要做刮宮手術了，就不是單純的藥物流產，所以大概的時間就是6個小時。
剛開始吃米非司酮的過程中間不疼，也許有一點小小的出血，基本上都不疼。如果吃米索前列醇，刺激子宮收縮，有的人可能會疼痛很厲害，甚至可能還會有惡心、嘔吐。大多數沒有那么難受，可以喝點熱水、稍微走動，可能能緩解疼痛。如果吃止疼藥，其實效果并不是特別好。坐著或者躺著，喝一點熱水，然后等待，也可以散步，會幫助藥物能夠快速起效，胎囊能夠迅速排出，排出以后基本就不疼了。
